Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF2IP78347 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2IP78347 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms