Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms