Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPD2P62316 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms