Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms