Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TMEM258P61165 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TMEM258P61165 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TMEM258P61165 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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