Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP10-9P60411 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP10-9P60411 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms