Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms