Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNU13P55769 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNU13P55769 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNU13P55769 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNU13P55769 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNU13P55769 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms