Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP2S1P53680 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms