Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOSBP53539 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOSBP53539 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOSBP53539 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOSBP53539 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOSBP53539 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOSBP53539 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms