Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCR4P51679 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCR4P51679 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCR4P51679 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCR4P51679 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms