Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PXNP49023 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PXNP49023 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PXNP49023 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms