Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLD2P49005 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLD2P49005 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLD2P49005 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLD2P49005 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD2P49005 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms