Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX5P48382 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX5P48382 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX5P48382 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX5P48382 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX5P48382 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX5P48382 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX5P48382 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX5P48382 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX5P48382 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms