Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GNPDA1P46926 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms