Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNA4P43681 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms