Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TNFSF9P41273 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms