Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DDIT3P35638 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms