Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKARP32238 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms