Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms