Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms