Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-FP30511 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms