Protein–RNA interactions for Protein: P30039

PBLD, Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBLDP30039 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PBLDP30039 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PBLDP30039 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms