Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CNGA1P29973 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms