Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP1P29466 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP1P29466 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP1P29466 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP1P29466 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP1P29466 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP1P29466 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP1P29466 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms