Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms