Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB2P29033 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB2P29033 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms