Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMB4P28070 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms