Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4AP27815 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms