Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTX3P26022 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTX3P26022 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms