Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNB1P20700 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LMNB1P20700 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms