Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms