Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACADSP16219 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACADSP16219 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACADSP16219 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACADSP16219 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms