Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB1P14653 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms