Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms