Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms