Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTXN2P0C2S0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTXN2P0C2S0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms