Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD4P09016 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms