Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRCP08575 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms