Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOP08100 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOP08100 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOP08100 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOP08100 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOP08100 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOP08100 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOP08100 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOP08100 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOP08100 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOP08100 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms