Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSLP07711 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSLP07711 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms