Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOA4P06727 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOA4P06727 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOA4P06727 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOA4P06727 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOA4P06727 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOA4P06727 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms