Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYBBP04839 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYBBP04839 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYBBP04839 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYBBP04839 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms