Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TK1P04183 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TK1P04183 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TK1P04183 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms