Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV2-5P01817 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV2-5P01817 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms