Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LTAP01374 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTAP01374 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LTAP01374 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTAP01374 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LTAP01374 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LTAP01374 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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LTAP01374 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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LTAP01374 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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