Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4K4O95819 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms