Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTBP3O95758 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms