Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POP4O95707 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POP4O95707 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POP4O95707 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POP4O95707 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POP4O95707 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms