Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMTA2O94983 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMTA2O94983 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms